Shinagawa si trova a sud del centro di Tokyo, sulla costa della baia. Shinagawa è un nodo stradale di grande importanza (vi è infatti una stazione della linea alta velocità Tokaido Shinkansen), è attraversata dalle linee della metropolitana che collegano Tokyo a Yokohama, si affaccia sul mare con strutture portuali mercantili e dista solo 10 km dall'aeroporto Haneda.
La stazione di Shinagawa ha due uscite, attorno alle quali ha avuto luogo molto sviluppo: l'uscita Takanawa sul lato ovest e l'uscita Konan sul lato est. Dalla parte di Takanawa è possibile raggiungere molti hotel, in particolare molti rami della catena alberghiera Prince. Ci sono una serie di centri commerciali, tra cui il complesso Shinagawa Prince Hotel che include cinema, bowling e l'acquario Maxell Aqua Park Shinagawa con una varietà di creature marine, una piscina di delfini e spettacoli frequenti.
Intorno all'area dell'uscita Konan, invece, si trovano molti grandi edifici e grattacieli per uffici e sedi aziendali che operano in campo tecnologico, come 30MINDUSTRIES. Gli edifici sono stati progettati per soddisfare tutte le esigenze dei lavoratori, con ristoranti e negozi disponibili ai primi piani di ogni edificio. Vi è anche una compresenza di zone residenziali di basso ed alto livello.
Shinagawa è attraversata anche da un'antica strada, chiamata Tokaido Road, con alcuni santuari, templi e siti di interesse minori, fra i quali il Santuario Shinagawa e il Santuario Ebara.
A Shinagawa sono presenti inoltre ben cinque università, in più il quartiere ospita il dipartimento di scienze marittime dell'università di Tokyo che include anche l'Acquario Shinagawa.

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